Rozwój ukierunkowanych na pojednanie z Żydami poglądów Jana Pawła II nastąpił – zdaniem obu dyskutantów – w dużym stopniu pod wpływem przyjaźni oraz doświadczeń wyniesionych z osobistych kontaktów Jana Pawła II z osobami pochodzenia żydowskiego. Niezwykle ważnym elementem relacji papieża z Żydami był jego stosunek do Zagłady.
Stanisław Krajewski zwrócił uwagę, że u początku pontyfikatu ocena Holocaustu formułowana przez Jana Pawła II nie do końca oddawała rozmiar i wyjątkowość okrucieństwa tego ludobójstwa. Jako przykład podawał tu słowa papieża wypowiedziane przez niego podczas wizyty w Auschwitz w 1979 roku, daleko odbiegające od pełnego odzwierciedlenia doznanej przez Żydów tragedii.
Niemniej jednak u schyłku pontyfikatu wyrażana przez Jana Pawła II ocena Holocaustu była zdecydowana, w sposób niezwykle jasny i jednoznaczny potępiająca ten akt nieludzkiego barbarzyństwa, o czym przypominał Janusz Poniewierski przytaczając stosowne cytaty z papieskich pism i publikacji.
- Często w środowisku polskich Żydów, a słyszałem nawet, takie zwroty także i zagranicą nazywano Jana Pawła II „naszym papieżem”. Po części zapewne wynikało to z łączących nas elementów polskości, ale także w dużym stopniu z rozmiaru wartości i wagi działań jakie podjął on na rzecz zbliżenia katolicko-żydowskiego – zakończył spotkanie Stanisław Krajewski.